El nom del barri té el seu origen en el convent de Sant Antoni, construït en el segle XV al costat de la muralla medieval de Barcelona.

Aquest convent portava el seu nom pel fet que estava dirigit per monjos antonians, una ordre especialitzada en el tractament d'una malaltia infecciosa greu de l'època, coneguda com el Foc de Sant Antoni. Aquesta malaltia era en realitat una intoxicació alimentària causada per la ingesta d'aliments contaminats per micotoxines, que la medicina més moderna desconeixia en aquells dies.

El convent de Sant Antoni jugava un paper crucial en retenir i tractar als afectats per aquesta malaltia que arribaven a Barcelona des del sud, evitant així que es propagués sense control per la ciutat.

Avui dia, aquest barri encara conserva l'essència històrica del seu nom i s'ha convertit en un lloc emblemàtic de Barcelona.